La esencia de la araña

Tras la partida de Mary Jane, Spider-Man es confrontado por un hombre llamado Ezekiel Sims, quien no solo posee las mismas habilidades arácnidas que el, sino que le plantea que sus poderes obedecen a un propósito místico y que tiene un destino que cumplir. A pesar de negar esta afirmación, Spider-Man comienza a enfrentar un creciente número de enemigos de naturaleza mística tales como Morlun o Shathra. Mary Jane eventualmente vuelve con Peter y comienza a buscar hacer una carrera como actriz seria. La tía May finalmente descubre el secreto de Peter y lo confronta. Tras la disolución del anterior grupo de Vengadores por acciones de la Bruja Escarlata, Spider-Man es invitado a formar parte del nuevo grupo de héroes. Poco después Spider-Man se muda a la torre de los Vengadores junto con May y Mary Jane luego de que su casa fuera destruida. También entabla una amistad con Tony Stark, (Iron Man).

Durante este periodo 2 eventos afectan radicalmente a Spider-Man. En el primero una mujer conocida como Queen, toma control de Spider-Man e induce una transformación en el que, aunque es revertida al final, afecta sus poderes permanentemente. Adquiere una fuerza aumentada (anteriormente con la capacidad de levantar 10 toneladas ahora 20 toneladas), desarrolla lanza redes orgánicos (haciendo inútiles los anteriores) y desarrolla un nivel de comunicación inconsciente con los insectos en general. El segundo cambio ocurre durante el evento llamado “The Other” (el otro) en el cual Spider-Man es brutalmente atacado por Morlun, quien buscaba alimentarse de la esencia mística de la araña en Peter. Para vencerlo, Spider-Man acepta dentro de si a su parte de araña y renace con otro conjunto de habilidades entre las que se encuentran reflejos mejorados, percibir vibraciones, mayor sentido del tacto y persecución (Como la piel de las arañas), visión nocturna y la capacidad de liberar 2 aguijones con veneno paralizante de sus muñecas. Como curiosidad de esta saga; aparece un fragmento de la oración El señor es mi pastor al final del cómic Amazing Spider-Man #526; "Aunque pase por oscuras quebradas de la muerte, no temeré ningún mal, porque tú estás conmigo...".